Systemutvecklare

vid Institutionen för biokemi och biofysik med placering vid Science for Life Laboratory. Sista ansökningsdag: 2016-05-08.

Science for Life Laboratory är ett nationellt centrum för storskalig forskning inom livsvetenskap med en avancerad teknologisk infrastruktur. Vid SciLifeLab utförs multidisciplinär forskning baserad på DNA-sekvensering, genexpressionsanalys, proteomik, bioinformatik, biostatistik och systembiologi. Målsättningen är att göra det möjligt för svenska forskare att analysera gener, transkript och proteiner i olika organismer i avsikt att klarlägga molekylära mekanismer relaterade till hälsa och miljö. Exempel på tematiska forskningsområden som för närvarande bearbetas inom SciLifeLab är klinisk genomik/proteomik, cancergenomik och komplexa sjukdomars genomik samt ekologisk och miljörelaterad genomik. Bioinformatik och systembiologi är centrala aktiviteter inom centret och en betydande del av personalen vid SciLifeLab arbetar inom dessa områden.

Plattformen National Genomics Infrastructure (NGI) vid Science for Life Laboratory är en nationell resurs som erbjuder storskalig sekvensering och analys av sekvensdata åt externa beställare. Faciliteten Genomics Applications Development i Stockholm säkerhetställer att de senaste applikationerna och den senaste utvecklingen i fältet kan göras tillgänglig för användarna av infrastrukturen.

Arbetsuppgifter
Vi söker nu en erfaren bioinformatiker/systemutvecklare gärna med tidigare erfarenhet av bioinformatik och dataanalys från storskalig sekvensering. Arbetet kommer att omfatta utvecklingsarbete med att förbättra våra metoder och verktyg för att analysera stora datamängder, främst från sekvensering av DNA och RNA med Illumina Hiseqs.

Du får möjlighet att jobba med de senaste teknikerna i fältet, ofta i form av samarbeten innan de släpps på marknaden, och de senaste metoderna från provpreparation till dataanalys. Vi jobbar i team, där både labb och bioinformatik samlas, och vi jobbar tillsammans för att sätta upp de senaste teknikerna för att stötta och möjliggöra genomikforskning över hela Sverige. Du kommer att leda projekt för utveckling av våra system för dataanalys.

Kvalifikationer
• Masterexamen inom datavetenskap eller bioinformatik, alternativt molekylärbiologi/bioteknik med inriktning mot databehandling eller motsvarande kompetens.
• Erfarenhet från liknande arbete med systemprogrammering.
• Väl förtrogen inom programmering, ex. Python, Perl, Javascript.
• Omfattande erfarenhet från att arbeta i Linux-/Unixmiljö.
• Erfarenhet av arbete med databaser (ex. noSQL) och versionshanteringsverktyg som git, SVN, cvs.
• Hantering av Illumina-data och metadata.
• Erfarenhet från att arbeta och programmera mot REST API (som mot Genologics LIMS).
• Erfarenhet av systemadministrering.
• Utmärkt kommunikations- och samarbetsförmåga.
• Att obehindrat kunna tala och skriva engelska.
• Vi letar efter dig som är noggrann, självgående och ansvarstagande. 

Extra meriterande:
• Erfarenhet av forskning inom genomik och intresse för molekylärbiologiska frågeställningar.
• Erfarenhet av high performance computing.
• Erfarenhet från projektmodellen Agile.

Anställningsvillkor
Anställningen avser heltid och gäller tills vidare med sex månaders provanställning. Tillträde snarast.

Stockholms universitet strävar efter att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika möjligheter för alla.

Kontakt
Närmare information om anställningen lämnas av Max Käller, [email protected]. För mer information, se: http://www.dbb.su.se och http://www.scilifelab.se.

Fackliga företrädare
Anqi Lindblom-Ahlm (Saco-S) och Lisbeth Häggberg (Fackförbundet ST), tfn 08-16 20 00 (vx), samt Gunnar Stenberg (SEKO), tfn 070-316 43 41.

Ansökan
Du söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem genom att klicka på knappen ”Ansök”. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Bifoga endast personligt brev och CV. Kopior på betyg och intyg tar du med vid en eventuell intervju.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: anvisningar – sökande.

Välkommen med din ansökan!

Stockholms universitet – hos oss ger utbildning och forskning resultat.