Postdoktor

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 54 000 studenter, mer än 7 500 anställda och en omsättning på cirka 8 miljarder kronor.

Postdoktor inom datoriserad bildbehandling med fokus på tillämpningar inom biomedicin

Institutionen för informationsteknologi har en ledande position inom såväl forskning som utbildning på alla nivåer.

Institutionen har i dag ca 300 anställda varav 120 lärare och 110 doktorander. Drygt 4000 studenter läser en eller flera kurser vid institutionen varje år och ett 30-tal forskargrupper är kopplade hit. Mer information om oss hittar du på institutionen för informationsteknologis webbplats.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

Forskningsprojekt: Tolkningsbar AI-baserad multispektral 3D-analys av strukturella egenskaper I tumörmikromiljön

Immunterapi har blivit ett livräddande alternativ för långt framskridna cancerpatienter. Men bara enminoritet av patienterna utvecklar ett varaktigt behandlingssvar. Med utgångspunkt från en stor samling förvärvade multispektrala histologiska bilder, syftar projektet tillatt utveckla avancerade tolkbara AI-drivna tillvägagångssätt för bildanalys, för karakterisering av denstrukturella 3D-organisationen och inbördes relationer mellan olika celltyper, vilket möjliggör tillförlitlig och förklarbar prediktion av patientens sjukdomsprogression.

Detta projekt är starkt beroende av tvärvetenskaplig kompetens och kommer att genomföras i nära samarbete med forskarna vid Institutionen för immunologi, genetik och patologi (IGP) vid Uppsala universitet. Tjänsten finansieras genom forskningsprojekt som bedrivs av MIDA-gruppen och finansieras av Cancerfonden och Vetenskapsrådet.

Arbetsuppgifter
Den antagna kandidaten kommer att ansluta sig till MIDA-gruppen och ta initiativ och ansvar för utveckling och utvärdering av avancerade AI-baserade metoder för analys av multidimensionella bilder av cancervävnad, riktat mot optimerad immunterapi för cancerpatienter.

I arbetsuppgifterna ingår metodutveckling, implementering, datahantering, utvärdering och analys, manuskriptberedning, handledning av masterstudenter och egen karriärutveckling.

Kvalifikationskrav
Doktorsexamen inom ett område som är nära relaterat till tjänsten t.ex datoriserad bildanalys/bildbehandling, dataanalys, datavetenskap eller en utländsk examen som bedöms motsvaradoktorsexamen inom ett område som är nära relaterat till tjänsten t.ex datoriserad bildanalys/bildbehandling, dataanalys, datavetenskap. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc.

Kandidaten ska ha dokumenterad erfarenhet av bildanalys, maskin- och djupinlärning, inclusive genomförda kurser på master- och forskarutbildningsnivå, samt förstahandserfarenhet av metodutveckling, implementering, utvärdering och publicering (förstaförfattare) av vetenskapliga artiklar i internationellt erkända tidskrifter och presentationer vid internationella konferenser. Programmering i Python och erfarenhet av att arbeta med djupinlärning i PyTorch-miljön är ett krav.

När vi väljer bland de sökande kommer vi att bedöma deras förmåga att självständigt driva sitt arbete framåt, att samarbeta med andra, att ha ett noggrant och professionellt förhållningssätt och att analysera och ta itu med komplexa problem.

Flytande engelska i tal och skrift krävs.

Önskvärt/meriterande i övrigt

- Erfarenhet av grafbaserade metoder, verktyg för nätverksanalys och graf/faltnings neurala nätverk;
- Erfarenhet av förklarbar AI (XAI);
- Erfarenhet av undervisning och handledning på universitetsnivå;
- Erfarenhet av programmering i Matlab, JavaScript, C++, Java, versionshantering med Git, typsättning med LaTeX, användning och administration av Linux-datorer, Bash scripting;
- Intresse för biomedicinsk forskning och erfarenhet av tillämpning av bildanalys inom medicin.

Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad i 2 år. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Prof. Nataša Sladoje (telefon: +46 721 828 722; e-post: [email protected] ); Prof. Joakim Lindblad (telefon: +46 733 168549; e-post: [email protected] ).

Välkommen med din ansökan senast den 6 april 2023 UFV-PA 2023/680.

Observera att detta är en förkortad version av annonsen. För att se den fullständiga annonsen vänligen klicka på ”Ansök här” eller se Uppsala universitets hemsida: https://www.uu.se/jobb

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.